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Le logo du NCBI évoque la double spirale de l'ADN.
Le National Center for Biotechnology Information (NCBI, « Centre américain pour les informations biotechnologiques ») est un institut national américain pour l'information biologique moléculaire.
Cet organisme, fondé en 1988 et situé à Bethesda dans le Maryland, fait partie de la Bibliothèque américaine de médecine, un des Instituts américains de la santé.
Sommaire
1Missions
2Notes et références
3Voir aussi
3.1Articles connexes
3.2Liens externes
Missions |
Le NCBI conduit des recherches dans la biologie informatique, développe des logiciels pour analyser des données de génome et fournir des informations biomédicales.
Le NCBI n'est pas une base de données, mais il développe aussi des bases de données publiques telles que :
GenBank
dbSNP
RefSeq
PubMed
Il est en quelque sorte le pendant américain de l’Institut européen de bio-informatique (EBI).
Le NCBI propose et contient une base de données NCBI taxonomy qui n'est qu'indicative. Le site internet du NCBI précise que cette base n'est pas une source fiable pour la nomenclature ou de classification, et qu'il faut consulter la littérature scientifique pertinente pour les informations les plus fiables[1]. La taxonomie du NCBI représente environ 10 % des espèces vivantes de la planète. Cette taxonomie est une classification curée et se propose comme une nomenclature organisée pour les séquences d'organismes dans des bases de données publiques[2]. Le TaxID (identifiant unique dans la taxonomie du NCBI) sert de lien entre les trois bases de données du International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC, « Collaboration internationale en bases de données de séquences nucléotidiques ») [3] dont sont membres la DNA Data Bank of Japan (DDBJ), le NCBI (USA) and l'Institut Européen de Bio-Informatique (EMBL-EBI, Europe)[4].
Notes et références |
↑ (en) « Disclaimer: The NCBI taxonomy database is not an authoritative source for nomenclature or classification - please consult the relevant scientific literature for the most reliable information. » (Voir bas de page sur cet exemple de recherche.)
↑ « Home - Taxonomy - NCBI », sur www.ncbi.nlm.nih.gov (consulté le 30 août 2017)
↑ (en) Scott Federhen, Karen Clark, Tanya Barrett et Helen Parkinson, « Toward richer metadata for microbial sequences: replacing strain-level NCBI taxonomy taxids with BioProject, BioSample and Assembly records », Standards in Genomic Sciences, vol. 9, no 3, 15 juin 2014, p. 1275 (ISSN 1944-3277, DOI 10.4056/sigs.4851102, lire en ligne)
↑ (en) « International Nucleotide Sequence Database Collaboration | INSDC », sur www.insdc.org (consulté le 30 août 2017)
Voir aussi |
Articles connexes |
Entrez, le système global de recherches inter-bases de données du NCBI.
BLAST, un logiciel du NCBI, permettant la comparaison de séquences de nucléotides et de protéines.
La liste des pages Wikipédia décrivant un taxon utilisant une référence au NCBI.
Liens externes |
(en) Site officiel
(en) Sa base de données taxonomique
v · m
Bio-informatique
Bases de données
Banques de séquences
.mw-parser-output .sep-liste{font-weight:bold} GenBank·EMBL Nucleotide Sequence Database·DNA Data Bank of Japan (DDBJ)
Secondaires
Protein Information Resource (PIR)·Swiss-Prot·TrEMBL·UniProt
Autres
Ensembl·InterPro·Ontologie des maladies·Protein Data Bank·HomoloGene
Génomiques spécialisées
FlyBase·Saccharomyces Genome Database·The Arabidopsis Information Resource·WormBase·Zebrafish Information Network·Mouse Genome Informatics
Institutions
Institut européen de bio-informatique (EBI)·Institut japonais de génétique·Institut suisse de bioinformatique·Centre américain pour les informations biotechnologiques (NCBI)
Algorithme
BLAST·FASTA·Smith-Waterman
Divers
ExPASy·Organismes de recherche en génétique
Alignement de séquences·Phylogénie moléculaire·Séquençage
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I am trying to find out how to save and close to an existing workbook using xlwings after writing in it: import xlwings as xw list_of_values = [1, 2, 3] workbook_path = 'abc.xlsx' wb = xw.Book(workbook_path) ws = wb.sheets['sheet1'] ws.range('E35').value = list_of_values wb.save() wb.close() When I get to wb.save(workbook_path) , there is a prompt stating: 'A file named abc.xlsx' already exists in this location. Do you want to replace it?' I want to overwrite the file immediately without the prompt coming up. According to the docs, wb.save() should automatically overwrite (see: https://docs.xlwings.org/en/v0.6.4/api.html). I have also tried wb.save(workbook_path) but the pop-up still appears. Appreciate any help on this please. p.s. - I am basically try...
Ne doit pas être confondu avec freeware, open source ou copyleft. Logo du projet GNU, initiateur du mouvement du logiciel libre. Un logiciel libre est un logiciel dont l'utilisation, l'étude, la modification et la duplication par autrui en vue de sa diffusion sont permises, techniquement et légalement [ 1 ] , ceci afin de garantir certaines libertés induites, dont le contrôle du programme par l'utilisateur et la possibilité de partage entre individus [ 2 ] . Ces droits peuvent être simplement disponibles – cas du domaine public – ou bien établis par une licence, dite « libre », basée sur le droit d'auteur. Les « licences copyleft » garantissent le maintien de ces droits aux utilisateurs même pour les travaux dérivés. Les logiciels libres constituent une alternative à ceux qui ne le sont pas, qualifiés de « propriétaires » ou de « privateurs » [ Note 1 ] . Ces derniers sont alors considérés par une partie de la communauté du logiciel libre comme étant l...
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I'm still learning PostgreSQL. During my testing, I have only been using INSERT statement in either psycopg2 and now asyncpg. I now have the need to UPDATE data in my test database, instead of replacing all of it. I'm currently trying to do a simple replacement test in a testing table, before I move to development table with more data. I want to replace any $1 name that is in CONFLICT with a name that is already in the table users. I'm trying the query code, which is passed to the DB via asyncpg. I keep getting a syntax errors, so I'm a little lost on how to correct these errors. What is the proper syntax for this query? '''INSERT INTO users(name, dob) VALUES($1, $2) ON CONFLICT (name) DO UPDATE "users" SET name = 'TEST' W...
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